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1990-10-25
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73KB
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2,027 lines
;Brookhaven Protein Data Bank entry: RIBONUCLEASE A (E.C.3.1.27.5) ;COMPLEX WITH URIDINE VANADATE (JOINT NEUTRON AND X-RAY) 6RSAB
;SOURCE BOVINE PANCREAS
;B.BORAH,C.-W.CHEN,W.EGAN,M.MILLER,A.WLODAWER,J.S.COHEN
;NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE AND NEUTRON DIFFRACTION STUDIES OF ;THE COMPLEX OF RIBONUCLEASE A WITH URIDINE VANADATE, A ;TRANSITION-*STATE ANALOGUE
;BIOCHEMISTRY V. 24 2058 1985
C = 1.5 (.5,.5,.5)
O = 1.4 (1.,0.,0.)
N = 1.5 (0.,0.,1.)
S = 2.04 (.85,.85,0.)
H = 0.90 (1.0, 1.0, 1.0)
V = 2.44 ( .5, 0, .5)
; LYS 1
N : 17.062 26.480 -2.135
C : 17.341 25.206 -1.322
C : 18.113 25.481 -0.046
O : 18.657 26.604 0.158
C : 18.040 24.499 -2.442
C : 19.071 23.473 -2.691
C : 20.362 24.269 -2.950
C : 21.422 23.191 -3.141
N : 22.814 23.741 -3.255
;H : 17.799 27.144 -1.932
;H : 17.242 26.271 -3.150
;H : 16.067 26.721 -2.032
;H : 16.354 24.816 -1.099
;H : 17.147 24.217 -3.078
;H : 18.507 25.363 -3.028
;H : 19.321 22.843 -1.840
;H : 18.874 22.820 -3.548
;H : 20.327 24.963 -3.772
;H : 20.597 24.820 -2.045
;H : 21.460 22.587 -2.226
;H : 21.222 22.551 -3.975
;H : 23.004 24.536 -2.629
;H : 23.425 22.916 -3.213
;H : 22.844 24.061 -4.280
; GLU 2
N : 18.285 24.508 0.865
C : 19.081 24.771 2.092
C : 20.518 25.166 1.776
O : 21.141 24.483 1.011
C : 19.158 23.542 2.953
C : 19.708 23.565 4.346
C : 19.661 22.118 4.838
O : 19.726 21.229 4.007
O : 19.466 22.003 6.047
;H : 17.872 23.636 0.667
;H : 18.674 25.602 2.635
;H : 18.142 23.068 2.963
;H : 19.757 22.824 2.347
;H : 20.693 23.895 4.551
;H : 19.006 24.006 5.047
; THR 3
N : 20.938 26.223 2.449
C : 22.300 26.722 2.370
C : 23.242 25.734 3.082
O : 22.895 24.903 3.899
C : 22.420 28.076 3.117
O : 22.061 28.030 4.484
C : 21.423 29.103 2.472
;H : 20.353 26.694 3.146
;H : 22.654 26.952 1.381
;H : 23.379 28.628 3.033
;H : 22.206 28.814 5.042
;H : 21.096 28.776 1.498
;H : 20.553 28.955 3.132
;H : 21.853 30.044 2.626
; ALA 4
N : 24.447 25.907 2.665
C : 25.540 25.079 3.215
C : 25.632 25.443 4.695
O : 25.852 24.543 5.542
C : 26.701 25.357 2.337
;H : 24.790 26.525 1.989
;H : 25.166 24.064 3.220
;H : 26.607 25.049 1.287
;H : 27.157 26.345 2.421
;H : 27.563 24.697 2.608
; ALA 5
N : 25.505 26.694 5.030
C : 25.603 27.036 6.458
C : 24.447 26.439 7.247
O : 24.755 25.949 8.401
C : 25.655 28.521 6.676
;H : 25.324 27.349 4.299
;H : 26.525 26.611 6.871
;H : 24.956 28.920 5.857
;H : 25.052 28.887 7.503
;H : 26.570 29.031 6.455
; ALA 6
N : 23.202 26.414 6.777
C : 22.084 25.842 7.455
C : 22.260 24.337 7.436
O : 21.781 23.789 8.437
C : 20.774 26.173 6.853
;H : 23.112 26.755 5.833
;H : 22.127 26.187 8.486
;H : 20.682 27.245 6.770
;H : 20.452 25.784 5.909
;H : 20.012 25.893 7.629
; LYS 7
N : 22.792 23.687 6.446
C : 23.051 22.261 6.410
C : 24.052 21.902 7.498
O : 23.797 20.868 8.140
C : 23.340 21.889 4.972
C : 23.672 20.406 4.902
C : 24.341 20.110 3.587
C : 25.141 18.821 3.793
N : 24.834 17.741 2.824
;H : 23.171 24.201 5.676
;H : 22.095 21.804 6.667
;H : 22.368 22.017 4.437
;H : 24.140 22.474 4.514
;H : 24.379 20.178 5.717
;H : 22.822 19.744 5.091
;H : 23.636 19.958 2.779
;H : 25.033 20.914 3.362
;H : 26.198 19.019 3.718
;H : 24.819 18.400 4.753
;H : 23.861 17.680 2.481
;H : 25.447 18.092 2.001
;H : 25.231 16.797 2.983
; PHE 8
N : 25.073 22.661 7.836
C : 26.036 22.471 8.899
C : 25.330 22.382 10.270
O : 25.630 21.551 11.137
C : 27.241 23.458 8.933
C : 28.237 23.234 9.997
C : 29.410 22.459 9.781
C : 28.048 23.742 11.298
C : 30.352 22.179 10.801
C : 28.909 23.463 12.311
C : 30.060 22.704 12.061
;H : 25.181 23.488 7.222
;H : 26.722 21.657 8.796
;H : 27.617 23.414 7.875
;H : 26.831 24.464 8.972
;H : 29.565 22.079 8.843
;H : 27.149 24.310 11.450
;H : 31.179 21.620 10.638
;H : 28.791 23.848 13.232
;H : 30.785 22.506 12.831
; GLU 9
N : 24.421 23.301 10.588
C : 23.678 23.385 11.785
C : 22.734 22.187 11.971
O : 22.555 21.656 13.095
C : 22.819 24.669 11.929
C : 23.547 25.869 12.500
C : 22.879 27.237 12.242
O : 23.601 28.214 11.776
O : 21.672 27.166 12.627
;H : 24.195 24.010 9.898
;H : 24.304 23.382 12.663
;H : 22.380 24.965 10.950
;H : 21.920 24.425 12.490
;H : 23.566 25.826 13.573
;H : 24.565 25.929 12.183
; ARG 10
N : 22.115 21.757 10.881
C : 21.174 20.600 10.911
C : 21.946 19.327 11.134
O : 21.400 18.523 11.924
C : 20.288 20.542 9.614
C : 19.421 19.299 9.515
C : 18.555 19.078 8.280
N : 19.267 19.271 7.046
C : 19.798 18.379 6.228
N : 19.640 17.090 6.540
N : 20.513 18.598 5.164
;H : 22.279 22.193 9.986
;H : 20.554 20.844 11.737
;H : 19.575 21.366 9.655
;H : 20.915 20.802 8.752
;H : 19.970 18.416 9.720
;H : 18.776 19.207 10.375
;H : 18.259 18.047 8.405
;H : 17.663 19.609 8.423
;H : 19.489 20.210 6.741
;H : 19.139 16.757 7.373
;H : 19.991 16.336 5.956
;H : 20.878 17.876 4.543
;H : 20.637 19.573 4.868
; GLN 11
N : 23.104 19.088 10.492
C : 23.871 17.891 10.630
C : 24.738 17.758 11.888
O : 25.012 16.617 12.322
C : 24.921 17.828 9.513
C : 24.085 17.750 8.223
C : 24.882 17.083 7.151
O : 24.593 16.071 6.608
N : 25.993 17.703 6.767
;H : 23.413 19.839 9.881
;H : 23.199 17.062 10.486
;H : 25.501 18.763 9.645
;H : 25.640 16.989 9.598
;H : 23.099 17.382 8.336
;H : 23.951 18.773 7.822
;H : 26.303 18.589 7.237
;H : 26.594 17.332 6.058
; HIS 12
N : 25.230 18.898 12.317
C : 26.242 18.947 13.375
C : 25.898 19.785 14.567
O : 26.792 19.563 15.408
C : 27.603 19.373 12.834
C : 28.078 18.527 11.629
N : 28.510 17.230 11.720
C : 28.112 18.871 10.298
C : 28.905 16.852 10.538
N : 28.670 17.815 9.626
;H : 25.058 19.774 11.899
;H : 26.432 17.931 13.708
;H : 27.567 20.442 12.515
;H : 28.354 19.241 13.612
;H : 28.640 16.647 12.581
;H : 27.872 19.823 9.855
;H : 29.275 15.842 10.304
;H : 28.817 17.745 8.617
; MET 13
N : 24.852 20.487 14.826
C : 24.780 21.193 16.126
C : 23.841 20.639 17.135
O : 22.715 20.455 16.743
C : 24.357 22.645 15.864
C : 25.327 23.578 15.231
S : 26.918 23.707 16.205
C : 26.049 24.385 17.658
;H : 24.199 20.574 14.063
;H : 25.812 21.120 16.465
;H : 23.368 22.592 15.351
;H : 24.004 23.031 16.815
;H : 25.823 23.273 14.319
;H : 24.998 24.605 15.220
;H : 25.404 25.150 17.206
;H : 25.472 23.625 18.099
;H : 26.812 24.792 18.288
; ASP 14
N : 24.175 20.401 18.377
C : 23.110 20.006 19.313
C : 23.364 20.778 20.655
O : 23.850 20.278 21.724
C : 22.896 18.523 19.457
C : 21.797 18.197 20.433
O : 20.884 18.974 20.612
O : 21.898 17.130 21.044
;H : 25.062 20.600 18.704
;H : 22.153 20.363 19.024
;H : 22.655 17.972 18.581
;H : 23.756 18.011 19.917
; SER 15
N : 23.010 22.029 20.585
C : 23.182 22.952 21.731
C : 22.309 22.639 22.868
O : 22.473 23.304 23.881
C : 22.447 24.288 21.332
O : 23.577 24.839 20.644
;H : 22.602 22.523 19.819
;H : 24.222 23.058 21.841
;H : 21.559 24.086 20.773
;H : 22.175 24.807 22.244
;H : 23.676 25.005 19.734
; SER 16
N : 21.423 21.784 22.601
C : 20.316 21.510 23.556
C : 20.602 20.499 24.662
O : 19.821 20.369 25.589
C : 19.092 21.272 22.691
O : 18.054 20.548 23.316
;H : 21.305 21.345 21.685
;H : 20.140 22.490 24.010
;H : 18.614 22.278 22.640
;H : 19.277 20.972 21.674
;H : 17.296 20.232 22.726
; THR 17
N : 21.731 19.924 24.464
C : 22.274 18.923 25.342
C : 23.732 19.195 25.553
O : 24.362 19.693 24.622
C : 21.944 17.690 24.496
O : 21.366 16.974 25.552
C : 23.055 16.899 23.851
;H : 22.320 20.116 23.678
;H : 21.627 18.882 26.206
;H : 21.187 18.061 23.785
;H : 21.631 16.327 26.225
;H : 23.860 16.952 24.574
;H : 22.763 15.839 23.764
;H : 23.325 17.415 22.957
; SER 18
N : 24.196 18.836 26.735
C : 25.620 19.030 27.093
C : 26.444 17.869 26.604
O : 27.604 18.097 26.280
C : 25.930 19.425 28.579
O : 25.032 20.365 29.224
;H : 23.579 18.476 27.435
;H : 25.876 19.950 26.597
;H : 26.225 18.560 29.100
;H : 26.732 20.188 28.473
;H : 24.161 19.878 29.264
; ALA 19
N : 25.933 16.706 26.465
C : 26.573 15.446 25.995
C : 25.454 14.489 25.563
O : 24.223 14.764 25.699
C : 27.372 14.930 27.153
;H : 25.003 16.550 26.698
;H : 27.246 15.689 25.178
;H : 27.629 15.681 27.925
;H : 26.944 14.120 27.735
;H : 28.408 14.611 26.937
; ALA 20
N : 25.737 13.358 24.913
C : 24.783 12.338 24.477
C : 24.472 11.699 25.839
O : 25.402 11.365 26.654
C : 25.319 11.216 23.588
;H : 26.737 13.190 24.842
;H : 23.946 12.753 23.957
;H : 26.316 10.878 23.811
;H : 24.664 10.351 23.631
;H : 25.317 11.607 22.551
; SER 21
N : 23.185 11.465 26.042
C : 22.758 10.925 27.381
C : 22.463 9.446 27.517
O : 22.313 8.983 28.660
C : 21.492 11.752 27.690
O : 20.814 11.559 26.422
;H : 22.548 11.800 25.328
;H : 23.484 11.270 28.095
;H : 20.954 11.379 28.547
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; MET 29
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; MET 30
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; LYS 31
N : 18.318 10.133 12.783
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; SER 32
N : 16.145 11.979 13.288
C : 15.361 13.231 13.397
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; ARG 33
N : 17.165 14.450 12.334
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; ASN 34
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; LEU 35
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; THR 36
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; ASP 38
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;H : 26.826 14.099 8.485
;H : 28.371 14.586 8.019
;H : 27.242 14.843 6.865
; PRO 42
N : 27.245 7.216 7.051
C : 28.120 6.399 7.807
C : 28.709 7.019 9.072
O : 28.814 6.312 10.061
C : 29.251 5.967 6.878
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;H : 27.558 5.622 8.262
;H : 30.136 6.092 7.390
;H : 29.301 4.930 6.726
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;H : 27.757 8.470 5.379
;H : 27.163 6.911 5.024
; VAL 43
N : 29.192 8.230 8.999
C : 29.808 8.913 10.135
C : 29.278 10.325 10.269
O : 29.384 11.069 9.277
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; ASN 44
N : 28.905 10.639 11.477
C : 28.484 12.014 11.721
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;H : 28.932 9.946 12.198
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; THR 45
N : 29.347 13.731 13.253
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; PHE 46
N : 28.111 15.409 16.110
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; VAL 47
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; HIS 48
N : 27.880 19.903 20.892
C : 27.140 20.345 22.095
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; GLU 49
N : 27.784 22.619 22.006
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;H : 27.459 22.615 21.024
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; SER 50
N : 27.521 26.198 22.048
C : 26.666 27.240 21.447
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; LEU 51
N : 26.098 27.924 19.239
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; ALA 52
N : 27.365 30.310 18.386
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; ASP 53
N : 30.121 29.885 19.537
C : 31.324 29.315 19.989
C : 31.729 28.402 18.781
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C : 31.401 28.461 21.239
C : 30.969 29.046 22.537
O : 31.176 30.216 22.506
O : 30.428 28.370 23.451
;H : 29.339 29.457 20.010
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; VAL 54
N : 30.784 27.849 18.137
C : 31.145 26.993 16.928
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O : 32.405 27.640 15.007
C : 30.207 25.815 16.759
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; GLN 55
N : 30.709 28.945 15.466
C : 30.961 29.938 14.394
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C : 29.918 30.983 14.318
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O : 27.306 32.288 14.640
N : 26.651 31.080 12.910
;H : 29.937 29.186 16.063
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; ALA 56
N : 32.735 30.900 15.800
C : 33.957 31.538 16.136
C : 35.166 30.717 15.734
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C : 33.984 31.803 17.677
;H : 32.213 30.567 16.609
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; VAL 57
N : 35.031 29.424 15.578
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; CYS 58
N : 35.923 29.843 13.028
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; SER 59
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; GLN 60
N : 39.944 31.099 14.485
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; LYS 61
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; ASN 62
N : 44.075 28.361 11.671
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; VAL 63
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C : 44.986 24.295 9.248
C : 44.440 23.759 7.868
O : 43.249 23.957 7.455
C : 44.723 23.369 10.492
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; ALS 64
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; CYS 65
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; LYS 66
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; LYS 67
;H : 38.720 11.395 6.408
N : 41.609 16.872 2.991
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; GLN 69
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; THR 70
N : 42.708 24.832 2.244
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; ASN 71
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; CYS 72
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; TYR 73
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; SER 75
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; TYR 76
N : 40.558 26.547 19.287
C : 41.620 26.681 20.294
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O : 44.318 31.430 17.043
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; SER 77
N : 40.049 25.538 21.797
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; THR 78
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; MET 79
N : 35.971 20.702 22.746
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; SER 80
N : 32.700 19.529 23.655
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; ILE 81
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; THR 82
N : 29.835 14.358 20.052
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; ASP 83
N : 30.384 11.443 18.500
C : 30.506 10.794 17.207
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C : 31.846 10.099 17.067
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O : 33.889 10.993 16.257
O : 32.177 12.218 16.054
;H : 30.665 11.027 19.354
;H : 30.373 11.434 16.349
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;H : 31.838 9.174 16.508
; CYS 84
N : 28.836 9.590 15.933
C : 27.901 8.538 15.539
C : 28.448 7.739 14.342
O : 28.666 8.302 13.298
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S : 25.811 10.183 16.325
;H : 28.845 10.346 15.275
;H : 27.598 7.848 16.292
;H : 26.911 9.980 14.370
;H : 25.826 8.615 14.633
; ARG 85
N : 28.692 6.486 14.549
C : 29.237 5.609 13.514
C : 28.317 4.423 13.314
O : 27.805 3.830 14.256
C : 30.511 5.025 14.040
C : 31.371 4.362 12.978
C : 32.202 5.594 12.653
N : 32.944 5.785 13.902
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;H : 28.502 6.049 15.450
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; GLU 86
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; THR 87
N : 26.949 0.884 12.661
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; GLY 88
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; SER 89
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; SER 90
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; LYS 91
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; TYR 92
N : 19.709 -0.190 5.880
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; ASN 94
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; TYR 97
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; THR 99
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; THR 100
N : 29.539 7.609 20.608
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; GLN 101
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; ALA 102
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; 103
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; ILE 106
N : 37.860 20.586 17.498
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; ILE 107
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; 110
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; GLU 111
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; TYR 115
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